Molibden, vücutta çeşitli enzimlerin yapısında yer alarak metabolizma süreçlerinde önemli roller üstlenir. Başlıca işlevleri şunlardır: Toksik maddelerin parçalanması: Sülfiti sülfata dönüştürerek vücutta toksik sülfit birikiminin önüne geçer. Oksidatif stresin azalması: Antioksidan enzimlerin aktivitesini artırarak serbest radikallerle savaşır. Enerji üretimi ve detoksifikasyon: Pürinlerin ürik aside dönüşümü ve aldehitlerin detoksifikasyonunda rol oynar. Bakır metabolizması: Tiyomolibdatlar aracılığıyla bakır emilimini engelleyerek bakır birikimi hastalıklarının tedavisinde kullanılır. Molibden, ayrıca yüksek sıcaklıklara dayanıklı alaşımların üretiminde, petrol endüstrisinde katalizör olarak ve boya endüstrisinde pigment olarak da kullanılır.