Facebook Messenger'da mesajları kapatmak için şu yöntemler kullanılabilir: Tek tek mesaj silme: Masaüstü uygulamasında, silmek istediğiniz mesaj veya fotoğrafa sağ tıklayıp "Kendin İçin Kaldır" seçeneğini kullanabilirsiniz. Site versiyonunda, fareyi silmek istediğiniz mesaj veya fotoğrafın üzerine getirip simgesine tıklayarak "Kaldır" seçeneğini kullanabilirsiniz. Tüm konuşmayı silme: Masaüstü uygulamasında, konuşmanın sağ üst köşesindeki dişli çark simgesine tıklayıp "Sil" seçeneğini kullanabilirsiniz. Ayrıca, gönderilen mesajları karşı taraftan silmek için "Herkesten Sil" özelliği kullanılabilir, ancak bu özellik yalnızca mesaj gönderildikten sonraki 10 dakika içinde kullanılabilir.