Mühür çeşitleri şu şekilde sınıflandırılabilir: Kullanım amacına göre: Resmî mühürler: Devlet işlerinde kullanılır. Şahsî mühürler: Kişisel kullanım için tercih edilir. Vakıf mühürleri: Vakıf kütüphanelerindeki kıymetli eserlere basılır. Yazılış şekline göre (Osmanlı dönemi): Kalp şeklinde; Badem şeklinde; Dikdörtgen; Sikke; Oval; Altıgen; Sekizgen; Şemse. Güvenlik mühürleri: Plastik kayış mühürler; Çelik telli mühürler; Kelebek sayaç mühürler; Konteyner mühürler; RFID mühürler. Ayrıca, Mezopotamya'dan günümüze kadar kullanılan mühürlerde insan ve hayvan figürleri, doğa motifleri ve çeşitli şekiller bulunur.