Hidrofor pompasının sürekli çalışması, çeşitli sorunlara yol açabilir: Pompa aşırı ısınabilir ve bu durum, pompa parçalarının zarar görmesine ve motorun yanmasına neden olabilir. Enerji tüketimi artar, bu da yüksek enerji maliyetlerine yol açar. Mekanik parçaların aşınması hızlanır, bu da hidroforun ömrünün kısalmasına sebep olabilir. Düşük verim nedeniyle basınç kayıpları veya yetersiz su basıncı gibi problemler yaşanabilir. Su kaçakları meydana gelebilir, bu da sistemin basıncı koruyamamasına yol açabilir. Gürültü kirliliği oluşabilir. Su kalitesi sorunları ortaya çıkabilir; aşırı basınç veya sürekli sirkülasyon, suyun içindeki tortu veya kirleticilerin karışmasına neden olabilir.