Pardus'ta iki ana masaüstü ortamı seçeneği bulunmaktadır: 1. XFCE: Daha hafif bir masaüstü ortamı olup, eski veya mütevazı donanıma sahip bilgisayarlar için önerilir. 2. GNOME: Daha modern ve görsel olarak çekici bir masaüstü ortamıdır, yeni ve güçlü donanıma sahip bilgisayarlar için uygundur. Ayrıca, KDE Plasma ve Cinnamon gibi diğer masaüstü ortamları da yüklenebilir. Hangi masaüstü ortamının daha iyi olduğu, kullanıcının tercihlerine ve sistem gereksinimlerine bağlıdır.