F-35 savaş uçaklarının en büyük kazası olarak değerlendirilebilecek bir olay, 24 Ocak 2022 tarihinde Güney Çin Denizi'nde USS Carl Vinson uçak gemisine iniş yaparken meydana gelen kaza olarak öne çıkmaktadır .
Bu kazada, F-35 savaş uçağı geminin güvertesine inmeye çalışırken güverteye çarpıp denize düşmüş, pilot ise fırlatma sistemiyle uçaktan atlayarak kurtulmuştur . Kazada 7 denizci yaralanmıştır .
F-35 savaş uçaklarının karıştığı diğer ciddi kazalar arasında, 2019 yılında Japonya'nın kuzeyinde Pasifik Okyanusu'na düşen ve pilotun hayatını kaybettiği kaza ile 2024 yılında New Mexico'da meydana gelen ve pilotun ciddi yaralanmalarla kurtulduğu kaza da bulunmaktadır .