"Atlantis: Beş Yıl Önce On Yıl Sonra" grubunun neden ayrıldığına dair bilgi bulunamadı. Ancak, "Yıldız Geçidi: Atlantis" dizisindeki Atlantis şehrinin ayrılmasının nedeni, Wraith adlı ırkın saldırıları ve galaksideki hayatın korunması ihtiyaçları olarak belirtilmiştir .
İlk olarak, Atlantis, Ori'lerin yaydığı vebaya benzer bir hastalıktan dolayı Dünya'dan ayrılarak Pegasus Galaksisi'ne gitmiş ve Lantea gezegenine yerleşmiştir . On yıl sonraki ayrılık ise, Atlantis'in Dünya'ya dönüşü ve ekonomik kriz nedeniyle gerçekleşmiştir .