Emin Müftüoğlu'nun Türkiye Bisiklet Federasyonu Başkanı olarak yaptığı bazı işler: Uluslararası ilişkiler: Üst düzey yarışlar ve seçkin sporcu ve kulüpleri Türkiye'ye getirmek, uluslararası takvime kayıtlı müsabakalar düzenlemek. Sporcu gelişimi: Antrenör desteği ve fon sağlamak, sporcu gelişim projelerine destek olmak. Organizasyonlar: Cumhurbaşkanlığı Türkiye Bisiklet Turu gibi etkinlikleri düzenlemek. Altyapı çalışmaları: Tesisleşme, sporcu ve antrenör yetiştirilmesi, teknolojik gelişmelere uyum sağlanması. Müftüoğlu, aynı zamanda Balkan Bisiklet Birliği Başkanı olarak da görev yapmaktadır.