Manisaspor ve Manisa FK aynı takım değildir, ancak birleşme sürecinde oldukları iddia edilmektedir. Manisa FK, 2019 yılında şirketleşerek belediye bünyesinden ayrılmış bir futbol kulübüdür. Her iki kulübün yöneticileri, birleşme sürecinin doğru ve sağlıklı bir şekilde ilerlemesi için Manisa FK yönetiminin istifa ettiğini duyurmuştur.