Fenerbahçe doktorlarının ayrılma sebepleri arasında sözleşmelerinin sona ermesi, yeni sağlık sponsorluk anlaşmaları yapılması veya kulüp içi kararlar yer alabilir. Örneğin, 2012 yılında Fenerbahçe Futbol Takımı doktoru Ertuğrul Karanlık'ın sözleşmesi sona erdiği için görevinden ayrıldığı belirtilmiştir.