Gençlik ve Spor Bakanlığı hiyerarşisi şu şekildedir: Bakan: Gençlik ve Spor Bakanlığının en üst amiridir. Müsteşar ve Müsteşar Yardımcıları: Bakana yardımcı olmak üzere görev yaparlar. Genel Müdürlükler: Gençlik Hizmetleri Genel Müdürlüğü, Spor Hizmetleri Genel Müdürlüğü, Kredi ve Yurtlar Genel Müdürlüğü gibi birimleri içerir. Taşra Teşkilatı: Gençlik ve spor il müdürlükleri, gençlik ve spor ilçe müdürlükleri, bağlı müdürlükler (yurt müdürlükleri, sporcu eğitim merkezi müdürlükleri vb.) şeklinde yapılanır. Hizmet Birimleri: İl müdürü, spor hizmetleri müdürü, gençlik hizmetleri müdürü, yurt hizmetleri müdürü gibi yöneticileri içerir. Ayrıca, Müşterek Komisyon gibi yapılar da merkez teşkilatı ilgili hizmet birimi amirinin başkanlığında oluşturulur ve belirli konularda değerlendirme yapar.