Fenerbahçe, UEFA şampiyonu olmamıştır. Ancak, UEFA organizasyonlarında çeşitli başarılar elde etmiştir: UEFA Avrupa Ligi (eski adıyla UEFA Kupası): 2012-13 sezonunda yarı final, 2015-16, 2022-23 ve 2024-25 sezonlarında ise son 16 turu başarısı göstermiştir. UEFA Şampiyonlar Ligi: 2007-08 sezonunda çeyrek final oynamıştır. UEFA Konferans Ligi (eski adıyla UEFA Avrupa Konferans Ligi): 2023-24 sezonunda çeyrek final oynamıştır. Fenerbahçe'nin UEFA şampiyonluğu bulunmamaktadır.