Çekya, Bohemya, Moravya ve Silezya olmak üzere üç ana coğrafi bölgeyi kapsar. Bohemya, ülkenin batı ve merkezi kısımlarını kaplar ve geniş bir havzada yer alır. Moravya, biraz daha engebeli bir yapıya sahiptir. Silezya, dağlık alanlar, ormanlık vadiler ve endüstri bölgeleriyle çok yönlü bir coğrafyaya sahiptir. Ayrıca, Çekya'nın 14 ili (kraj) bulunmaktadır.