Ontario Gölü, çeşitli nedenlerle tehlikeli olarak değerlendirilebilir: 1. Kirlilik: Göl, endüstriyel ve tarımsal faaliyetler sonucu oluşan kirlilikle karşı karşıyadır. 2. İstilacı Türler: Deniz lampreyi ve zebra midyeleri gibi istilacı türler, yerli balık popülasyonlarına zarar vermektedir. 3. Habitat Degradasyonu: İnsan faaliyetleri, gölün kıyılarını değiştirerek doğal habitatları bozmaktadır. 4. İklim Değişikliği: Artan sıcaklıklar ve değişen yağış desenleri, gölün termal yapısını ve su seviyelerini etkileyerek yeni zorluklar yaratmaktadır. Bu sorunlar, hem gölün biyolojik çeşitliliğini hem de çevresindeki toplulukların sağlığını olumsuz etkilemektedir.