Acemoğlu Kanyonu, derin yapısı ve iki dağın altına doğru oyuk olması nedeniyle balık adamlar tarafından yapılan araştırmalarda bile tam olarak incelenememiştir 3. Zaman zaman bu nehirde 2 metreye yakın balıklar tutulmaktadır 3.

Ayrıca, Acemoğlu Boğazı Köprüsü'nün tehlike saçması da kanyonun tehlikeli olmasının bir diğer nedenidir 4. Bu köprü, Erzincan-Kemah kara yolunun 35. kilometresinde, Karasu Nehri üzerinde yer almakta olup, tek gözlü ve kesme taştan yapılmıştır 4. Köprü, 22 Nisan 1996'da bir askeri aracın kanyona uçması sonucu 14 askerin şehit olduğu dramatik bir olaya sahne olmuştur 4.

Acemoğlu Kanyonu'na giderken, sola doğru keskin bir virajla inildikten sonra köprünün sağa doğru yine keskin bir dönüş yapması, hızlı giden araçların kanyona uçma riskini artırmaktadır 3.