Trabekülektomi ameliyatı, bazı riskler içeren bir cerrahi işlemdir. Bu riskler arasında: Postoperatif enfeksiyon. Sarkık göz kapağı ve çift görme. Şişlik, kanama ve ameliyat sahasının yakınında bir delik oluşması. Yara izi ve düşük göz içi basıncı (hipotoni). Ağır vakalarda, etkilenen gözün içinde kanama, koroid dekolmanı ve görme kaybı gibi daha ciddi komplikasyonlar da görülebilir. Ameliyat öncesi ve sonrası dönemde doktor kontrolünde olmak, bu risklerin minimize edilmesine yardımcı olabilir.