Araştırma hastanesi ile devlet hastanesi arasındaki temel farklar şunlardır: Eğitim ve Araştırma Faaliyetleri: Araştırma hastaneleri, tıp öğrencisi ve uzmanlık öğrencisi yetiştiren hastanelerdir. Ekipman ve Donanım: Araştırma hastaneleri, genellikle daha üst seviyede ekipman ve donanıma sahiptir. Döner Sermaye: Araştırma hastanelerinin döner sermayesi, devlet hastanelerine göre daha fazla olabilir. Ayrıca, araştırma hastanelerinde hastaların denek olarak kullanıldığı veya doktorların kota doldurmak için hastaları ameliyat etmeye zorladığı gibi iddialar da bulunmaktadır.