Antibiyotiklerin yan etkileri, kullanılan antibiyotik türüne, hastanın sağlık durumuna ve tedavi süresine bağlı olarak değişiklik gösterebilir. Antibiyotiklerin yaygın yan etkileri şunlardır: Sindirim sistemi sorunları: Mide bulantısı, ishal, kusma, karın krampları veya iştahsızlık. Mantar enfeksiyonları: Ağızda veya vajinada mantar enfeksiyonlarının (pamukçuk) gelişme riskinin artması. Alerjik reaksiyonlar: Ciltte döküntü, kurdeşen, kaşıntı, nefes almada zorluk, yüzde veya boğazda şişme. Baş ağrısı ve baş dönmesi: Bazı antibiyotikler bu tür merkezi sinir sistemi etkilerine yol açabilir. Fotosensitivite: Cildin güneşe karşı daha hassas olması, kolay güneş yanığına yol açabilir. Böbrek ve karaciğer üzerindeki etkiler: Çok daha nadir olmakla birlikte, antibiyotik türüne bağlı olarak bu organların fonksiyonlarında bozulma görülebilir. Herhangi bir yan etki görüldüğünde mutlaka doktora danışılması gerekmektedir.