Kalp kapak ameliyatı, büyük bir cerrahi müdahale olduğu için zor bir ameliyat olarak kabul edilir. Ameliyatın zorluğu, hastanın genel sağlık durumu, kapak hasarının türü ve şiddeti, ameliyatın türü (onarım veya değiştirme) gibi faktörlere bağlı olarak değişebilir. Kalp kapak ameliyatının olası riskleri arasında kanama, enfeksiyon, anestezi komplikasyonları, kan pıhtısı oluşumu, kalp ritim bozuklukları, inme ve kalp krizi bulunur. Her cerrahi müdahalede olduğu gibi, kalp kapak ameliyatlarında da risk bulunmaktadır. Bu nedenle, ameliyat kararı verilirken mevcut hastalığın riski ile ameliyatın riski karşılaştırılır.