Kalp kapak ameliyatı, genel olarak zor bir ameliyat olarak kabul edilir. Ameliyatın zorluğu, hastanın genel sağlık durumu, kapakların yapısı ve ameliyatın yapılacağı yöntem gibi faktörlere bağlıdır. Her cerrahi işlemde olduğu gibi, kalp kapak ameliyatında da anesteziye bağlı reaksiyonlar, enfeksiyon, kan pıhtısı oluşumu gibi riskler bulunmaktadır.