Flukopol, aşağıdaki mantar türlerine etkilidir: Mayalar dahil olmak üzere Candida adı verilen mantarın neden olduğu enfeksiyonlar; Cryptococcus mantarı kaynaklı menenjit ve akciğer ile deri gibi diğer bölgelerdeki enfeksiyonlar; Kan dolaşımı, vücut organları (kalp, akciğerler), karın zarı ve idrar yolu gibi iç organlarda bulunan mantarlar. Bu ilaç, mantar enfeksiyonlarını tedavi etmek ve mantar enfeksiyonu kapmayı önlemek için kullanılır.