İstanbul'da en iyi tıp fakültesinin Çapa mı yoksa Cerrahpaşa mı olduğu konusunda kesin bir görüş yoktur. İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, 2025 yılı taban puanları sıralamasına göre İstanbul'un en iyi tıp fakülteleri arasında dördüncü sırada yer almaktadır. İstanbul Üniversitesi (Çapa) Tıp Fakültesi ise, 2023 yılında hazırlanan URAP raporuna göre Türkiye'nin en iyi tıp fakülteleri arasında ikinci sırada yer almaktadır. En iyi tıp fakültesinin seçimi, kişisel tercihlere ve önceliklere göre değişiklik gösterebilir.