Blastocystis spp paraziti, genellikle gastrointestinal ve dermatolojik hastalıklara neden olabilir. Gastrointestinal semptomlar arasında ishal, karın ağrısı, şişkinlik, gaz ve bulantı yer alır. Parazitin patojenitesi tam olarak kanıtlanmamış olsa da, bazı durumlarda bağışıklık sistemi zayıflamış kişilerde (HIV/AIDS hastaları gibi) daha ciddi sağlık sorunlarına yol açabileceği düşünülmektedir. Teşhis ve tedavi için bir sağlık uzmanına başvurulması önerilir.