Seirei Gensouki (Spirit Chronicles) anlatısı, 20 yaşındaki üniversite öğrencisi Haruto Amakawa'nın bir trafik kazasında ölmesi ve ardından Rio adında genç bir çocuğun bedeninde yabancı bir dünyada uyanmasıyla başlar 24.

Haruto'nun anıları ve kişilikleri kaynaştıkça, Rio artık kendisinin de sihirli güçlere sahip olduğunu fark eder 24. Yeni kimliğine rağmen, annesinin katillerinden intikam alma tutkusunun azalmadığını görmek onu rahatlatır 24.

Kısa bir süre sonra Rio, Bertram Krallığı'nın kaçırılan prensesiyle karşılaşır ve onu tereddüt etmeden kurtarır 2. Kral, minnettarlığını ifade etmek için ona Bertram Kraliyet Akademisi'ne kaydolma fırsatı verir 2. Bunun hayatında yeni bir sayfa açacağına inanan Rio, bu prestijli akademide okuyacağı için heyecanlıdır, ancak soyluların görkemli çocuklarıyla çevrili bir gecekondu sakini için buradaki hayat zor olacaktır 2.