Resident Evil 6, küresel çapta biyoterörist bir saldırıyı konu alır. Oyunun hikayesi şu ana hatlara sahiptir: 1. Leon'un Hikayesi: ABD Başkanı'nın konuşmasını engellemek için düzenlenen bir saldırı sırasında Leon, başkanın kızını kurtarmak için çabalar ve kasabayı zombilerden temizlemeye çalışır. 2. Chris'in Hikayesi: Chris, enfekte olmuş yerel halkı yok etmek için gönderilen bir BSAA ekibine liderlik eder ve Ada Wong'un da dahil olduğu bir düşmanla mücadele eder. 3. Jake'in Hikayesi: Jake, Edonia'da bir biyolojik silahın peşindedir ve bu silahın yaratıcısı olan babasının intikamını almaya çalışır. 4. Ada'nın Hikayesi: Ada, hem Leon ve Chris ile işbirliği yapar hem de kendi gizli amaçlarını kovalar. Hikayeler, Çin, Amerika ve Doğu Avrupa'daki çeşitli yerlerde geçer ve altı aylık bir zaman dilimini kapsar.