Digimon ve Pokemon farklı evrenlerde yer almaktadır. Pokemon, gerçek dünyada yaşayan et ve kandan oluşan hayvanların hikayesine odaklanır. Digimon ise, dijital dünyadan gelen ve bilgisayar ekranında yumurta olarak belirip gerçek dünyaya inen yaratıkların hikayesidir.