PES 2013'e Süper Lig yaması kurmak için aşağıdaki adımlar izlenebilir: 1. PeSBoX Anatolia 2013 yaması kurulumu: Eski "pesbox-server" klasörü silinmelidir. "PeSBoX Anatolia 2013 v0.7 Installer.exe" dosyası ile yama kurulmalı ve PES 2013 kurulum yolunun doğru olduğundan emin olunmalıdır. Kurulum bittikten sonra oyunun kurulu olduğu yerdeki "PeSBoX Anatolia 2013 Selector.exe" çalıştırılmalıdır. 2. exTRpack 13 yaması kurulumu: Kitserver ve img dosyaları oyunun kurulu olduğu klasöre, save dosyası ise belgelerdeki ilgili yere atılmalıdır. Yamadaki installer ile oyunun kurulu olduğu klasör seçilmeli ve editör kurulmalıdır. Yama kurulumu sırasında bir uzmandan destek alınması önerilir. Ayrıca, PES 2013 için 2024 transfer yaması da mevcuttur, ancak bu yama ücretlidir.