MiSide oyunu, psikolojik korku ve görsel roman unsurlarını birleştiren bir hikayeye sahiptir 14.

Oyunun konusu şu şekilde özetlenebilir:

Ana karakter, mobil bir oyunda sanal bir kız olan Mita'ya bakmakla görevlendirilir 2. Bir gün, beklenmedik bir şekilde Mita'nın dijital dairesine ışınlanır ve onunla olan bağı bir sonraki seviyeye taşımaya çalışır 2. Ancak kısa sürede, Mita'nın evinin bir hapishaneye dönüştüğünü fark eder ve buradan bir yol bulup kaçmaya çalışır 2. Mita ise partnerini yanında tutmak için elinden gelen her şeyi yapar 2.

Bu süreçte, her biri hikayede farklı bir role sahip olan diğer karakterlerle tanışır 2.