Black Desert Online oyununun hikayesi, dört ana ülke olan Calpheon, Serendia, Balenos ve Media'nın Valencia ile olan etkileşimlerine odaklanır. Valencia, haritanın sağ tarafında bulunan büyük bir ülkedir ve Media, Valencia ile diğer ülkeler arasında yer alır. Savaşın ardından, diğer ülkeler Media'nın güçlü bir ülke haline geldiğini görür ve Calpheon, diğer ülkelerin taşlarını çalmaya karar verir. Oyun, bu çatışmaların ortasında kalan kahramanların hikayesini anlatır.