Ben 10: Uzaylı Kovanı, Ben Tennyson ve arkadaşlarının, dünyayı düşman uzaylı işgalcilerden korumaya çalışan gizli bir organizasyon olan Tesisatçılar'ın bir parçası olmasını konu alır. Ancak, bir eski dostun geri dönmesiyle Ben, zor bir seçim yapmak zorunda kalır: Ya babası Elena'ya yardım edecek ve onun tehlikeli bir uzaylı komplosuna karışma riskini alacak ya da Tesisatçıların lideri Büyükbaba Max'in yanında kalacaktır.