Baldi's Basics in Education and Learning oyununun hikayesi, bir okulda geçen ve karakterin 7 defteri toplayıp okuldan kaçmaya çalıştığı bir yapıya sahiptir. Oyunun ana olayları şu şekildedir: - Karakterimiz, arkadaşımızın okulda unuttuğu defterleri toplarken Baldi tarafından sorulan soruları cevaplamak zorundadır. - Bir soruyu yanlış cevapladığında Baldi sinirlenir ve karakteri kovalamaya başlar. - Okulda, Baldi'ye yardım eden ve karakterin ilerlemesini yavaşlatabilecek diğer karakterler de bulunmaktadır. - Tüm defterleri topladıktan sonra, karakter çıkış kapısına giderek okuldan kaçmayı başarır.