Tünelin içinde trenin geçişi, çeşitli güvenlik ve yapısal tedbirlerle sağlanır: 1. Çift Tüp Sistemi: Özellikle uzunluğu 5000 metreden fazla olan tünellerde, güvenlik açısından çift tüp sistemi tercih edilir. 2. Tahliye Koridorları: Tünellerde, yolcuların sorunsuz bir şekilde tahliye edilebilmesi için yaya tahliye koridorları bulunur. 3. Yangın Güvenliği: Tünellerde yangın söndürme sistemleri ve otomatik yangın dedektörleri bulunur. 4. Havalandırma: Tünellerde, trenin geçişi sırasında oluşan hava akımını dengelemek için havalandırma sistemleri kurulur. 5. Acil Durum Planları: Acil durumlar için tünel içinde ve dışında acil durum telefonları, kaçış merdivenleri ve toplanma alanları gibi tedbirler alınır.