Skoda Karoq modelinde çeşitli motor seçenekleri bulunmaktadır: Benzinli Motorlar: 1.0 TSI (999 cc, 115 HP, 200 Nm tork); 1.5 TSI (1498 cc, 150 HP, 250 Nm tork). Dizel Motorlar: 1.6 TDI (1500 cc, 115 HP, 250 Nm tork); 2.0 TDI (190 HP ve 190 PS, 400 Nm tork). Ayrıca, 1.5 TSI motor seçeneğinde kasım ayından itibaren 4×4 çekiş özelliği de sunulacaktır.