Mazda 3'te hangi motorun daha iyi olduğu, kullanım amacına ve kişisel tercihlere bağlıdır. Benzinli motor, yüksek güç üretimi ve düşük tüketimiyle öne çıkar. Dizel motor, yüksek tork sayesinde yokuşlarda daha güçlü performans sunar. Her iki motor seçeneği de manuel ve otomatik şanzıman seçenekleriyle sunulur.