Kubota M9540 traktörü, F18/R18 ve F36/R36 şanzıman seçeneklerini kullanmaktadır. F18/R18 şanzıman: 18 ileri ve 18 geri vites sunar ve ağır işler için hidrolik shuttle modellerde bulunur. F36/R36 şanzıman: Dual Speed özelliği ile 36 ileri ve 36 geri vites sağlar ve M9540 DHC-DS modelinde standart olarak sunulur.