Kuzey Marmara Otoyolu'nda geçiş ücreti, kullanılan aracın sınıfına göre hesaplanır. Araç sınıfları ve kapsadıkları araç tipleri: 1. sınıf: Otomobiller. 2. sınıf: Minibüsler. 3. sınıf: Yolcu otobüsleri. 4. sınıf: Kamyonlar. 5. sınıf: Tır ve treyler. Geçiş ücretleri, giriş ve çıkış noktalarına göre değişiklik gösterebilir. Otoyol geçiş ücretleri genellikle HGS (Hızlı Geçiş Sistemi) üzerinden tahsil edilir.