İstanbul'daki en uzun tren hattı, Marmaray (Halkalı - Gebze)'dir. Bu hat, 15 dakika aralıklarla sefer yapan ve toplamda 43 durağı bulunan bir banliyö tren hattıdır. Gebze'den Halkalı'ya kadar uzanan bu hat, yaklaşık 115 dakika sürmektedir. Diğer yüksek hızlı tren hatlarına bakıldığında, en uzun hat Ankara - İstanbul YHT hattıdır. Bu hat, Ankara'dan İstanbul'un Halkalı istasyonuna kadar uzanır ve yaklaşık 533 kilometre uzunluğundadır. Ancak, İstanbul'daki en uzun tren hattı olarak Marmaray öne çıkmaktadır.