Honda CR-V'de tutulan motor seçenekleri arasında farklı modeller bulunmaktadır: 2.0L Hibrit Motor: 184 PS güç ve 335 Nm tork üretir, elektronik sabit hızlı şanzıman (E-CVT) ile donatılmıştır. 1.6 i-DTEC Dizel Motor: 160 HP güç ve 350 Nm tork üretir, 9 ileri otomatik şanzıman ile sunulur. 1.5L VTEC Turbo Motor: Benzinli olup, VTEC teknolojisi ile benzin ve hava karışımını ideal düzeyde tutarak 193 PS güç ve 243 Nm tork üretir. Ayrıca, Honda CR-V'nin tam hibrit (e:HEV) versiyonu da bulunmaktadır ve bu model, hareket ettikçe kendi bataryasını şarj edebilir.