HGS geçiş ihlali durumunda, geçiş ücretinin dört katı ceza uygulanır. Geçiş ihlalinin hesaplanması için aşağıdaki adımlar izlenir: 1. İhlalli geçiş yapılan köprü veya otoyol belirlenir. 2. Geçiş ücreti hesaplanır ve bu ücret HGS hesabından tahsil edilemez. 3. 15 gün içinde HGS hesabına bakiye yüklenirse, ceza uygulanmaz ve sadece geçiş ücreti tahsil edilir. 4. 15 günü geçen durumlarda, 30 günlük ek süre tanınır ve ödenmesi gereken tutar 2'ye katlanır.