Performans hava filtreleri, düzenli bakım ve temizlik yapıldığında motora zarar vermez. Ancak, bu filtrelerin bazı dezavantajları vardır: Yakıt tüketimini artırabilir. Daha çabuk kirlenir ve tıkanır. Motora partiküllerin ulaşmasını engelleyemez. Yüksek devirlerde pistonların zarar görmesine neden olabilir. Performans hava filtresinin tıkandığını gösteren belirtiler arasında egzozdan gelen koyu renk duman, motorda titreme, hızlanma süresinde artış ve çekiş gücünde düşüş bulunur. Performans hava filtresi kullanmadan önce, olası dezavantajları göz önünde bulundurarak bir uzmana danışılması önerilir.