Kız Kulesi'nin yapılma amaçları tarih boyunca değişiklik göstermiştir: MÖ 410 yılında, Atinalı komutan Alkibiades tarafından Boğaz'dan geçen gemileri kontrol etmek ve vergi almak amacıyla inşa ettirilmiştir. Bizans döneminde, İmparator Manuel Komnenos tarafından kule güçlendirilerek bir savunma binası haline getirilmiştir. Osmanlı döneminde, Fatih Sultan Mehmet tarafından yeniden inşa ettirilmiş ve gözetleme kulesi, gümrük noktası, karantina merkezi ve deniz feneri olarak kullanılmıştır.