Pepee: Birlik Zamanı filmi, Pepee'nin dedesinin laboratuvarında ürettiği sıcak hava balonu ile Türkiye semalarında kaybolmasını ve evine dönmeye çalışmasını anlatıyor. Bu süreçte Pepee, önce Adıyaman-Nemrut, Urfa-Göbeklitepe ve en son Kapadokya'ya gider.