Uygur metinleri ve Göktürk yazıtları arasındaki temel farklar şunlardır: 1. Yerleşik Hayat ve Savaş İçeriği: Uygur metinleri yerleşik hayatta yazılmış olup, daha çok barış ve din konularını ele alırken, Göktürk yazıtları genel olarak savaş içerikleri ve devlet düzeniyle ilgilidir. 2. Alfabe: Uygur metinlerinde Uygur alfabesi, Göktürk yazıtlarında ise Göktürk alfabesi kullanılmıştır. 3. Toplumsal Yapı: Göktürk yazıtlarında toplumsal ve sosyal devletten bahsedilirken, Uygur metinlerinde maniheizm gibi farklı dinlerden bahsedilir.