Ölüler Şehri'nin terk edilme nedeni, bulunduğu bölgedeki yerleşim yerlerinin tarihsel olarak terk edilmesidir. Örneğin, Suriye'nin kuzeybatısındaki Ölü Şehirler (Dargavs gibi) 7. yüzyılın ilk yarısında, Bizans topraklarının Müslümanlar tarafından fethinden sonra, ticaret yollarının değişmesi nedeniyle yerel ekonomilerin çökmesiyle terkedilmiştir. Ayrıca, Mısır'daki Ölüler Şehri (El Karafa) terk edilmiş bir şehir izlenimi verse de, aslında insanlarla doludur; yaşlısından gencine, en zengininden yoksuluna kadar her kademeden insan burada yaşamaktadır.