My Little Pony: Gökkuşağı Yolculuğu, Hope Hollow kasabasındaki Rainbow Festivali'nin onur konuğu olmak için bir davetiye alan Rainbow Dash ve arkadaşlarının maceralarını anlatıyor. Kasabaya giderken bir reklam panosuna çarpmaları sonucu, kasaba ve sakinleri renksiz kalır. Arkadaşları ile birlikte jeneratörü tamir etmeye çalışan Rainbow Dash ve diğerleri, kasabanın rengini geri getirmek için çaba harcarlar.