My Little Pony evreninde en çok sevilen karakter konusunda kesin bir görüş yoktur. Ancak, bazı karakterlerin popüler olduğu görülmektedir: Twilight Sparkle: Serinin ana karakteri olup, büyü elementini temsil eder. Pinkie Pie: Neşeli ve sosyal yapısıyla dikkat çeker. Rainbow Dash: Cesur ve hızlı bir Pegasus olup, sadakatiyle bilinir. Rarity: Zarif ve modaya düşkün bir Unicorn'dur. Fluttershy: Utangaç ve nazik bir Pegasus olup, hayvanlarla iletişim kurma yeteneğine sahiptir. Ayrıca, Princess Celestia ve Princess Luna gibi prensesler de sevilen karakterler arasındadır.