Müge Anlı, gazeteci Burhan Akdağ ile iki kez evlenip boşandı. İlk boşanma, 2008 yılında gerçekleşti ve çiftin kızları Lidya'nın velayetini Müge Anlı aldı. İkinci boşanma, Müge Anlı'nın eşinden şiddet gördüğü gerekçesiyle açtığı dava sonucunda gerçekleşti.