Malta Kuşatması'nın başarısız olmasının birkaç nedeni vardır: 1. Komutanlar Arasındaki Anlaşmazlık: Kuşatmanın başında Serdar Mustafa Paşa ve Kaptan-ı Derya Piyale Paşa arasında adanın nasıl ele geçirileceği konusunda görüş ayrılıkları vardı, bu da saldırıları koordinasyonsuz ve etkisiz hale getirdi. 2. Stratejik Hatalar: Osmanlılar, öncelikle St. Elmo Kalesi'ni kuşatarak yanlış mevkilere hücuma geçtiler ve bu kalenin etrafının sürekli denizden gelecek tehditlere açık olması savunmayı zorlaştırdı. 3. Dış Yardımların Gelmesi: Malta Şövalyeleri'ne, özellikle Sicilya'dan gelen İspanyol yardım birlikleri destek sağladı ve bu da Osmanlıların işini zorlaştırdı. 4. Mevsim Koşulları: Mevsim değişmeye başlaması ve kötü hava koşulları kuşatmanın uzamasına ve sonunda kaldırılmasına neden oldu.