Malta Kuşatması'nın başarısız olmasının bazı nedenleri: Komutada iki başlılık: Kuşatma planında hata yapılarak ilk önce Saint Elmo Kalesi'nin kuşatılması, Serdar Mustafa Paşa ile Kaptan-ı Derya Piyale Paşa arasındaki anlaşmazlık nedeniyle gerçekleşmiştir. Lojistik hazırlık eksikliği: Yeterli erzak ve mühimmat yığınağı yapılmamış, lojistik destek İstanbul'dan gönderilmeye çalışılmıştır. Donanmanın etkin kullanamaması: Donanma, adayı abluka altına alamamış, bu yüzden Malta'ya yardım götüren Osmanlı gemileri İspanyolların eline geçmiştir. Mevsim koşulları: Mevsim değişiminin başlaması ve Sicilya'dan gelen yardım kuvvetlerinin adaya çıkması, kuşatmanın kaldırılmasına yol açmıştır. Kale yapısı: 16. yüzyılda "trace italienne" tarzında inşa edilen kalelerin etrafında su dolu hendek bulunması, Osmanlı kuvvetlerinin avantaj sağlamasını zorlaştırmıştır.