Küçük Ağa dizisinin ilk bölümünde İstanbul'un varlıklı bir ailesinin kızı olan Sinem ve Urfalı bir ağanın oğlu olan Ali, 10 yıllık evliliklerini bitirme kararı alırlar. 6 yaşındaki Mehmet Can, anne ve babasının ayrılmaması için elinden geleni yapar ancak bu çabaları sonuç vermez. Bu süreçte, ayrılıktan hoşnut olmayan aile büyükleri de olaya dahil olur. Küçük Ağa, çevresindeki olumsuzlukları çocuk aklıyla çözmeye çalışan bir karakterin hikayesini anlatır.